Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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