Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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PtpraP18052 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms