Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms