Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FosbP13346 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FosbP13346 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FosbP13346 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms