Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04213 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04213 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P04213 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P04213 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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