Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01734 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01734 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01734 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01734 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01734 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01734 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms