Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pak1O88643 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pak1O88643 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms