Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Stra6O70491 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Stra6O70491 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Stra6O70491 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Stra6O70491 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Stra6O70491 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stra6O70491 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms