Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vamp8O70404 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp8O70404 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms