Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lnx1O70263 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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