Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Foxq1O70220 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms