Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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