Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2f6O54917 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2f6O54917 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms