Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms