Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52l1O54818 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms