Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms