Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Opn1mwO35599 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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