Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms