Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5458L7N219 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5458L7N219 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5458L7N219 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5458L7N219 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm5458L7N219 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5458L7N219 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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