Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm6593-201ENSMUST00000211165 1135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pilrb1-206ENSMUST00000199387 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Duxbl1-203ENSMUST00000172667 2209 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms