Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms