Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21900J3QP38 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21900J3QP38 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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