Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20918J3QN17 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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