Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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