Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms