Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Vmn1r167G3UW71 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Vmn1r167G3UW71 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Vmn1r167G3UW71 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r167G3UW71 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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