Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms