Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm28048F7BCN0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm28048F7BCN0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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