Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20671F6TVX7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms