Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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