Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms