Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms