Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms