Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd1D3YXK1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms