Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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