Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia4B8QI36 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms