Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Usf3B2RUQ2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms