Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms