Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Grik3B1AS29 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Grik3B1AS29 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Grik3B1AS29 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Grik3B1AS29 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Grik3B1AS29 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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