Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms