Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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