Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vstm4T1NXB5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vstm4T1NXB5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms