Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl9-ps1S4R1R7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl9-ps1S4R1R7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms