Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer1Q9Z2Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Homer1Q9Z2Y3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Homer1Q9Z2Y3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms