Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbd4Q9Z2D7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd4Q9Z2D7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd4Q9Z2D7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms