Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdpk1Q9Z2A0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdpk1Q9Z2A0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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