Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cpne6Q9Z140 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms