Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stau1Q9Z108 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stau1Q9Z108 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stau1Q9Z108 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stau1Q9Z108 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stau1Q9Z108 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stau1Q9Z108 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stau1Q9Z108 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.6 ms