Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcn5Q9WVD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn5Q9WVD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn5Q9WVD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms