Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnni1Q9WUZ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms